В письме ФНС от 14 сентября 2021 г. № БС-4-11/13022@ указано, что при получении налогоплательщиком дохода в виде материальной выгоды, указанной в подпункте 3 пункта 1 статьи 212 НК РФ, налоговая база по налогу на доходы физических лиц определяется как превышение рыночной стоимости, в частности, ценных бумаг над суммой фактических расходов налогоплательщика на их приобретение.

При реализации ценных бумаг, которые были получены в собственность, в том числе на безвозмездной основе или с частичной оплатой, а также в порядке дарения или наследования, в составе расходов на их приобретение при определении финансового результата (в соответствии с пунктом 12 статьи 214.1 Налогового Кодекса) может быть учтена сумма полученной от их приобретения материальной выгоды, с которой был исчислен налог на доходы физических лиц, при условии, что данный налог был фактически уплачен в бюджет.

В ситуации, когда в одном налоговом периоде налогоплательщиком был получен доход от приобретения ценных бумаг и доход от реализации таких ценных бумаг (их части), в форме 3-НДФЛ суммы материальной выгоды могут быть учтены в качестве расходов, связанных с приобретением этих ценных бумаг, при условии:

– отражения в налоговой декларации дохода, полученного в виде такой материальной выгоды от приобретения ценных бумаг и подлежащего налогообложению по соответствующей ставке;

– самостоятельной уплаты физическим лицом суммы налога с такого дохода в виде материальной выгоды от приобретения ценных бумаг до представления налоговой декларации формы 3-НДФЛ.

<Письмо> ФНС России от 14.09.2021 № БС-4-11/13022@ «О налогообложении доходов физических лиц».